Палаты Парламента имеют полномочия, которые осуществляют самостоятельно.
1. Каждая из палат Парламента назначает на пятилетний срок на должность двух членов Счетного комитета по контролю за исполнением республиканского бюджета. Счетный комитет — это государственный орган, непосредственно подчиненный и подотчетный Президенту. Президент назначает Председателя Счетного комитета. Правительство назначает четырех членов Счетного комитета. Таким образом. Счетный комитет является органом законодательной и исполнительной власти, образуемым на паритетных началах.
2. В случае устойчивой неспособности Президента осуществлять свои обязанности по болезни Парламент образует комиссию, состоящую из равного от каждой палаты числа депутатов. Кандидатуры членов комиссии предлагаются депутатами Мажилиса и Сената, их постоянными комитетами и избираются на их пленарном заседании. Комиссия рассматривает материалы, связанные с состоянием здоровья Президента, и представляет свое заключение Парламенту.
3. Для решения вопросов, касающихся совместной деятельности Палат, Сенат и Мажилис вправе на паритетных началах образовывать совместные комиссии. Совместные комиссии являются рабочими органами Парламента и отчитываются непосредственно перед ним.
4. Мажилис и Сенат самостоятельно прекращают полномочия своих депутатов, а также по представлению Генерального прокурора Республики решают вопросы лишения депутатов Палат их неприкосновенности.
5. Каждая из Палат по вопросам своей компетенции проводит парламентские слушания. Парламентские слушания являются организационной формой деятельности Палаты. Слушания проводятся с целью предварительного обсуждения важнейших вопросов, входящих в компетенцию Палаты. Как правило, парламентские слушания открыты для представителей средств массовой информации и общественности. Могут проводиться закрытые слушания, если затрагиваются сведения, составляющие государственную и иную охраняемую законом тайну.
6. По инициативе не менее одной трети от общего числа депутатов Палаты: Мажилис и Сенат — вправе заслушивать отчеты членов Правительства по вопросам их деятельности. В случае принятия решения о недоверии члену Правительства Палата обращается к Президенту об освобождении от должности члена Правительства или о привлечении его к уголовной ответственности.
7. Каждая из Палат Парламента имеет свои координационные и рабочие органы. Координационными органами Мажилиса и Сената являются Бюро в составе Председателей палат, их заместителей и председателей постоянных комитетов.
Из числа депутатов палат образуются постоянные комитеты. Комитеты палат являются рабочими органами и создаются для ведения законопроектной работы, предварительного рассмотрения и подготовки вопросов, дачи заключений по вопросам, внесенным на рассмотрение палат. Число постоянных комитетов в каждой Палате не должно превышать семи. В Мажилисе численный состав каждого комитета не может быть менее 7 депутатов, в Сенате — менее 6 депутатов. Комитеты по вопросам своей компетенции издают решения в виде постановлений и заключений.
Полномочия и порядок деятельности комитетов и комиссий определяются Законом Республики Казахстан О комитетах и комиссиях Парламента Республики Казахстан от 7 мая 1997 г.
Заседания постоянных комитетов проводятся по мере необходимости, но не реже двух раз в месяц. Заседания являются открытыми. Могут проводиться и закрытые заседания. По обсуждаемым вопросам постоянные комитеты принимают постановления. Постоянные комитеты вправе проводить совместные заседания.